Course

Construire un modèle déterministe simple

Ce cours constitue la cinquième partie d'une série de cinq cours conçue pour les professionnels de la santé publique, les data scientists, les épidémiologistes, les travailleurs de la santé, les décideurs politiques et toute personne intéressée par la modélisation des maladies infectieuses, la réponse aux épidémies et l'analyse de données tenant compte du genre.

Overview

Cette unité offre une introduction complète à la construction et à l’analyse de modèles épidémiologiques déterministes, en se concentrant sur l’épidémie de virus Zika de 2016 qui a touché l’Amérique latine et les Caraïbes et a été désignée comme une urgence de santé publique de portée internationale (USPPI) par l’Organisation Mondiale de la Santé.
En s’appuyant sur la théorie épidémiologique fondamentale, vous développerez un modèle de type SIR déterministe intégrant les facteurs démographiques pour examiner la dynamique interconnectée de la transmission des maladies entre humains et vecteurs. Par le biais d’une analyse structurée des relations régissant ces interactions, vous traduirez les dynamiques conceptuelles de la maladie en équations mathématiques qui constituent la base de la simulation et de l’analyse informatiques à l’aide du langage de programmation R.
L’unité met l’accent sur les applications pratiques des concepts épidémiologiques clés, notamment les cadres de modèle SIR, les seuils d’immunité collective et les mesures de contrôle fondées sur des preuves, telles que la pulvérisation de vecteurs, les moustiquaires imprégnées d’insecticide et les programmes de vaccination. Par le biais d’études de cas et du développement de modèles, vous acquerrez les compétences quantitatives nécessaires pour évaluer l’impact des épidémies et comparer systématiquement les stratégies d’intervention afin d’éclairer la prise de décision en santé publique.

Résultats d’apprentissage

  • Comprendre comment un modèle déterministe simple est construit à l’aide d’équations différentielles ordinaires.
  • Identifier les paramètres pertinents pour la modélisation des épidémies de maladies à transmission vectorielle (MTV).
  • Apprendre à créer un diagramme pour un modèle compartimental.
  • Traduire les équations mathématiques d’un modèle déterministe en code R.
  • Utiliser des simulations pour explorer les scénarios de transmission et l’impact potentiel des interventions.

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